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OpenAI

Interroger RNAcentral pour une entrée d’ARN, ou une correspondance croisée

rnacentral-skill

En bref

Cette skill interroge l’API RNAcentral pour parcourir des entrées d’ARN, en consulter une, ou en lire les correspondances croisées, en format compact. Les appels passent par `rest_request.py` vers `https://rnacentral.org/api/v1`. On peut ouvrir une entrée par identifiant et taxon (`rna/URS000075C808/9606`), chercher (`rna/` avec un `q` et `page_size=10`, `record_path` `results`) ou lister les correspondances d’une entrée (`rna/…/xrefs/`). `max_items=10` convient bien aux listes et aux correspondances ; une fiche isolée n’a en général pas besoin d’un plafond aussi serré. Le rendu par défaut est un Markdown court ; le JSON n’est fourni que s’il est demandé. En conversation longue, on relance ; un `...` d’aperçu reste une troncature d’interface.

Ce que ça fait

  • Interroge RNAcentral v1 (fiche, recherche, correspondances croisées) via `rest_request.py`.
  • Plafonne typiquement les listes et xrefs à `max_items=10`.
  • Rend un résumé Markdown, JSON brut seulement sur demande.
  • Relance la requête dans une discussion longue, sans recopier un `...` d’interface.

Pour qui, et un exemple

Les spécialistes d’ARN non codants qui veulent un aperçu RNAcentral d’une entrée, d’une recherche ou de ses correspondances, sans tout paginer.

Exemple de demande : « Ouvre l’entrée URS000075C808 chez l’humain dans RNAcentral, puis liste une dizaine de ses xrefs. »

À choisir pour une synthèse RNAcentral (fiche, recherche ou correspondances croisées) en format compact, via l’API publique v1 documentée. Exemple rédigé par iadujour.fr à partir du SKILL.md, non testé.

Installer

Dans Codex : codex plugin add life-science-research@openai-curated (marketplace officielle du dépôt).

codex plugin add life-science-research@openai-curated

Fonctionne avec

  • Codex

Source : README : collection de plugins Codex ; la marketplace du dépôt s’appelle « Codex official ». D’autres agents ne sont pas nommés.

Niveau : Intermédiaire

Suppose un projet déjà en place chez l’éditeur et les outils décrits dans le SKILL.md.

À savoir

Dépôt officiel OpenAI. Ce sont des exemples de plugins Codex, souvent rédigés par l’éditeur du plugin (Figma, Stripe, Canva, etc.) et hébergés ici. Skill du plugin « life-science-research » dans openai/plugins.

Extrait du SKILL.md

La description d’origine, celle que l’agent lit pour décider de charger la skill (en anglais) :

Submit compact RNAcentral API requests for RNA entry browsing, single-entry lookup, and cross-reference retrieval. Use when a user wants concise RNAcentral summaries

Citée depuis le SKILL.md au commit 768f4e7 . Le dossier contient aussi 2 fichiers annexes (agents/, scripts/).

Le SKILL.md compte 34 lignes et 6 sections principales :

  • Operating rules
  • Execution behavior
  • Input
  • Output
  • Execution
  • References

Licence : Aucune licence trouvée

Consultée le 10 novembre 2026 : aucun fichier de licence dans le dossier ni à la racine du dépôt.

Aucune licence trouvée : extrait court cité uniquement (droit de courte citation). Pour le texte complet, consultez la source.

Source. Fiche rédigée par iadujour.fr à partir de : Frontmatter, sections et corps du SKILL.md, README du dépôt. Consultée le 10 novembre 2026. openai/plugins .
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