En bref
Cette skill interroge le service NCBI PMC Open Access pour savoir si un article ou ses fichiers sont disponibles, en format compact. Les appels passent par `scripts/ncbi_pmc.py`, pas par le client REST générique. On passe les paramètres sous `params`, typiquement un `id` qui est un PMCID (par exemple PMC3257301) ou un DOI reconnu par le service. Le rendu par défaut est un Markdown court issu de la sortie du script ; le XML brut n’est enregistré que s’il est demandé. Ce n’est pas Entrez général, ni Datasets, ni BLAST : ces flux relèvent des skills sœurs. En conversation longue, on relance ; un `...` d’aperçu reste une troncature d’interface.
Ce que ça fait
- Interroge PMC Open Access via `ncbi_pmc.py`, à partir d’un PMCID ou d’un DOI.
- Rend un résumé Markdown de la disponibilité de l’article ou des fichiers.
- N’enregistre le XML brut que s’il est explicitement demandé.
- Laisse Entrez, Datasets et BLAST aux skills sœurs correspondantes.
Pour qui, et un exemple
Un service de documentation scientifique qui doit vérifier qu’un article est bien dans PMC Open Access, sans lancer un Entrez général ni télécharger le XML par défaut.
Exemple de demande : « Vérifie si PMC3257301 et ce DOI sont disponibles en Open Access PMC, en résumé compact, sans sauvegarder le XML. »
À ouvrir pour une synthèse PMC Open Access (disponibilité d’un article ou de fichiers), dès qu’un PMCID ou un DOI suffit. Exemple rédigé par iadujour.fr à partir du SKILL.md, non testé.
Installer
Dans Codex : codex plugin add life-science-research@openai-curated (marketplace officielle du dépôt).
codex plugin add life-science-research@openai-curatedFonctionne avec
- Codex
Source : README : collection de plugins Codex ; la marketplace du dépôt s’appelle « Codex official ». D’autres agents ne sont pas nommés.
Niveau : Intermédiaire
Suppose un projet déjà en place chez l’éditeur et les outils décrits dans le SKILL.md.
À savoir
Extrait du SKILL.md
La description d’origine, celle que l’agent lit pour décider de charger la skill (en anglais) :
Submit compact NCBI PMC Open Access requests for article/file availability metadata. Use when a user wants concise PMC Open Access summaries; save raw XML only on request.
Citée depuis le SKILL.md au commit 27651a4 . Le dossier contient aussi 2 fichiers annexes (agents/, scripts/).
Le SKILL.md compte 32 lignes et 6 sections principales :
- Operating rules
- Execution behavior
- Input
- Output
- Execution
- References
Licence : Aucune licence trouvée
Vérifiée le 10 novembre 2026 sur : aucun fichier de licence dans le dossier ni à la racine du dépôt.
Aucune licence trouvée : extrait court cité uniquement (droit de courte citation). Pour le texte complet, consultez la source.
Commentaires.
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