En bref
Cette skill interroge l’API ChEMBL pour des activités, des molécules, des cibles, des mécanismes et une recherche textuelle, en restant compacte. Les appels passent par `rest_request.py` vers `https://www.ebi.ac.uk/chembl/api/data`. Pour une collection (activité, mécanisme, recherche), on commence par `limit=10` côté API et `max_items=10` ; une molécule ou une cible isolée n’a en général pas besoin de plafond. On peut par exemple lister les activités d’un `molecule_chembl_id`, ou chercher une molécule par texte (`molecule/search.json`). Le rendu par défaut est un Markdown court ; le JSON n’est recopié que s’il est demandé. En discussion longue, on relance ; un `...` d’interface n’entre pas dans la requête.
Ce que ça fait
- Interroge ChEMBL (activité, molécule, cible, mécanisme, recherche) via `rest_request.py`.
- Part de `limit=10` et `max_items=10` sur les collections ; une fiche isolée n’a en général pas besoin de plafond.
- Rend un résumé Markdown, et ne livre le JSON que sur demande.
- Relance plutôt que de réutiliser une sortie ancienne.
Pour qui, et un exemple
Un ou une pharmacologue qui explore ChEMBL — activité d’une molécule, cible, mécanisme — et veut d’abord une vue courte, pas un dump de l’API.
Exemple de demande : « Liste une dizaine d’activités ChEMBL pour CHEMBL25, puis cherche les molécules correspondant à imatinib. »
On y recourt pour une synthèse ChEMBL compacte : activité, molécule, cible, mécanisme ou recherche textuelle. Exemple rédigé par iadujour.fr à partir du SKILL.md, non testé.
Installer
Dans Codex : codex plugin add life-science-research@openai-curated (marketplace officielle du dépôt).
codex plugin add life-science-research@openai-curatedFonctionne avec
- Codex
Source : README : collection de plugins Codex ; la marketplace du dépôt s’appelle « Codex official ». D’autres agents ne sont pas nommés.
Niveau : Intermédiaire
Suppose un projet déjà en place chez l’éditeur et les outils décrits dans le SKILL.md.
À savoir
Extrait du SKILL.md
La description d’origine, celle que l’agent lit pour décider de charger la skill (en anglais) :
Submit compact ChEMBL API requests for activity, molecule, target, mechanism, and text-search endpoints. Use when a user wants concise ChEMBL summaries
Citée depuis le SKILL.md au commit 27651a4 . Le dossier contient aussi 2 fichiers annexes (agents/, scripts/).
Le SKILL.md compte 35 lignes et 6 sections principales :
- Operating rules
- Execution behavior
- Input
- Output
- Execution
- References
Licence : Aucune licence trouvée
Vérifiée le 10 novembre 2026 sur : aucun fichier de licence dans le dossier ni à la racine du dépôt.
Aucune licence trouvée : extrait court cité uniquement (droit de courte citation). Pour le texte complet, consultez la source.
Commentaires.
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