En bref
Cette skill interroge ChEBI pour des entités chimiques, en format compact. Les appels passent par `rest_request.py` ; les chemins documentés passent sous `https://www.ebi.ac.uk` et le préfixe `chebi/backend/api/public/`, plutôt que sous un autre hôte. Une recherche typique utilise `chebi/backend/api/public/es_search/`, un `query` (par exemple « caffeine »), `size=10`, un `record_path` `results` et `max_items=10`. On restitue un Markdown court par défaut ; le JSON n’est fourni que s’il est demandé, et `save_raw` seulement sur demande. En conversation longue, on relance plutôt que de réutiliser une ancienne sortie ; un `...` d’aperçu d’outil est une troncature d’interface, pas le texte à renvoyer.
Ce que ça fait
- Interroge l’API publique ChEBI, sous le préfixe `chebi/backend/api/public/`, via `rest_request.py`.
- Plafonne typiquement une recherche (`es_search`, `size` et `max_items` à 10).
- Rend un résumé Markdown, et n’enregistre le brut que sur demande.
- Relance la requête dans une discussion longue, sans recopier un `...` d’interface.
Pour qui, et un exemple
Les chimistes et curateurs d’entités qui veulent un aperçu ChEBI d’un composé ou d’une classe, sans extraire toute l’ontologie d’un coup.
Exemple de demande : « Cherche la caféine dans ChEBI et résume une dizaine de résultats, via l’API publique documentée. »
À choisir pour une synthèse ChEBI compacte, dès qu’une recherche ou une fiche d’entité chimique est demandée via l’API publique EBI. Exemple rédigé par iadujour.fr à partir du SKILL.md, non testé.
Installer
Dans Codex : codex plugin add life-science-research@openai-curated (marketplace officielle du dépôt).
codex plugin add life-science-research@openai-curatedFonctionne avec
- Codex
Source : README : collection de plugins Codex ; la marketplace du dépôt s’appelle « Codex official ». D’autres agents ne sont pas nommés.
Niveau : Intermédiaire
Suppose un projet déjà en place chez l’éditeur et les outils décrits dans le SKILL.md.
À savoir
Extrait du SKILL.md
La description d’origine, celle que l’agent lit pour décider de charger la skill (en anglais) :
Submit compact ChEBI 2.0 API requests for chemical search, compound lookup, ontology traversal, and structure metadata. Use when a user wants concise ChEBI summaries
Citée depuis le SKILL.md au commit 27651a4 . Le dossier contient aussi 2 fichiers annexes (agents/, scripts/).
Le SKILL.md compte 33 lignes et 6 sections principales :
- Operating rules
- Execution behavior
- Input
- Output
- Execution
- References
Licence : Aucune licence trouvée
Consultée le 10 novembre 2026 : aucun fichier de licence dans le dossier ni à la racine du dépôt.
Aucune licence trouvée : extrait court cité uniquement (droit de courte citation). Pour le texte complet, consultez la source.
Commentaires.
Un retour d’expérience, une question, une précision sur cette skill ? Les commentaires sont relus avant publication.
Commentaires publiés
Chargement des commentaires…
Laisser un commentaire
Charte de modération. Chaque commentaire est relu avant publication. Sont refusés : l’incitation à la haine, les propos injurieux ou discriminatoires, la publicité, le spam et les liens promotionnels, le hors-sujet et les données personnelles d’autrui.