En bref
Exécutez ou planifiez des workflows d'appel de variantes de cellules germinales profondes, WGS, WES, panel ciblé, cohorte, ou trio avec des références-construction, des sites connus, QC, des appels conjoints et des vérifications d'annotation.
Ce que ça fait
- Éléments essentiels
- Itinéraire
- Points de décision
Pour qui, et un exemple
Personnes dont la tâche correspond à : Exécuter ou planifier des workflows d'appel de variantes avec référence-construction, sites connus, QC, co-appel et annotation.
Exemple de demande : « Variantes de l'ADN germinal : Exécutez ou planifiez des workflows d'appel de variantes de cellules germinales profondes, WGS, WES, panel ciblé, cohorte, ou trio avec des références-construct »
Exécutez ou planifiez des workflows d'appel de variantes de cellules germinales profondes, WGS, WES, panel ciblé, cohorte, ou trio avec des références-construction, des sites connus, QC, des appels conjoints et des vérifications d'annotation. Exemple rédigé par iadujour.fr à partir du SKILL.md, non testé.
Installer
Dans Codex : codex plugin add ngs-analysis@openai-curated (marketplace officielle du dépôt).
codex plugin add ngs-analysis@openai-curatedFonctionne avec
- Codex
Source : README : collection de plugins Codex ; la marketplace du dépôt s’appelle « Codex official ». D’autres agents ne sont pas nommés.
Niveau : Intermédiaire
Suppose un projet déjà en place chez l’éditeur et les outils décrits dans le SKILL.md.
À savoir
Extrait du SKILL.md
La description d’origine, celle que l’agent lit pour décider de charger la skill (en anglais) :
Run or plan deep germline WGS, WES, targeted-panel, cohort, or trio variant-calling workflows with reference-build, known-sites, QC, joint-calling, and annotation checks.
Citée depuis le SKILL.md au commit d420d13 . Le dossier contient aussi 1 fichier annexe (agents/).
Le SKILL.md compte 80 lignes et 4 sections principales :
- Essential Inputs
- Route
- Decision Points
- Outputs
Licence : Aucune licence trouvée
Consultée le 13 novembre 2026 : .
pas de fichier LICENSE dans le dossier de la skill Pour le texte complet, consultez la source.
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