DES CAS D’USAGE D’IA À REPRENDRE.Édition française · Particuliers, indépendants, TPE
OpenAI

Amplicon Microbiome

ngs-amplicon-microbiome

En bref

Démarrage public 16S, 18S, ITS, COI, ou d'autres flux de travail de microbiome d'amplicon de type marqueur au moyen de nf-core/ampliseq, QIIME2, DADA2 et Cutadapt.

Ce que ça fait

  • Éléments essentiels
  • Défauts publics
  • Prévol

Pour qui, et un exemple

Personnes dont la tâche correspond: Démarrage public 16S, 18S, ITS, COI, ou d'autres flux de travail de microbiome amplicon de marqueur-genre utilisant nf-core/ampliseq, QIIME2, DADA2 et Cutadapt.

Exemple de demande : « Amplicon Microbiome : Démarrage public 16S, 18S, ITS, COI, ou d'autres flux de travail de microbiome d'amplicon de type marqueur au moyen de nf-core/ampliseq, QIIME2, DADA2 et Cutada »

Démarrage public 16S, 18S, ITS, COI, ou d'autres flux de travail de microbiome d'amplicon de type marqueur au moyen de nf-core/ampliseq, QIIME2, DADA2 et Cutadapt. Exemple rédigé par iadujour.fr à partir du SKILL.md, non testé.

Installer

Dans Codex : codex plugin add ngs-analysis@openai-curated (marketplace officielle du dépôt).

codex plugin add ngs-analysis@openai-curated

Fonctionne avec

  • Codex

Source : README : collection de plugins Codex ; la marketplace du dépôt s’appelle « Codex official ». D’autres agents ne sont pas nommés.

Niveau : Intermédiaire

Suppose un projet déjà en place chez l’éditeur et les outils décrits dans le SKILL.md.

À savoir

Dépôt officiel OpenAI. Ce sont des exemples de plugins Codex, souvent rédigés par l’éditeur du plugin et hébergés ici. Skill du plugin « ngs-analysis » dans openai/plugins.

Extrait du SKILL.md

La description d’origine, celle que l’agent lit pour décider de charger la skill (en anglais) :

Kick off public 16S, 18S, ITS, COI, or other marker-gene amplicon microbiome workflows using nf-core/ampliseq, QIIME2, DADA2, and Cutadapt.

Citée depuis le SKILL.md au commit d420d13 . Le dossier contient aussi 1 fichier annexe (agents/).

Le SKILL.md compte 100 lignes et 7 sections principales :

  • Essential Inputs
  • Public Defaults
  • Preflight
  • Local Execution Package
  • Kickoff Pattern
  • Visualization Outputs
  • Guardrails

Licence : Aucune licence trouvée

Consultée le 13 novembre 2026 : .

pas de fichier LICENSE dans le dossier de la skill Pour le texte complet, consultez la source.

Source. Fiche rédigée par iadujour.fr à partir de : Frontmatter, sections et corps du SKILL.md, README du dépôt. Consultée le 13 novembre 2026. openai/plugins .
MÊME ÉDITEUR

Autres skills OpenAI : Productivité et organisation

Toute la catégorie
OpenAIProductivité et organisation

ARN-séq monocellulaire

ngs-scrna-seq

Faites passer les FASTQs monocellulaires ou mononucléosiques à des flux de travail publics de génération de nombres et reportez la matrice de nombres Qc, l'annotation, le regroupement et l'analyse UMAP à l'habileté scrna-seq-qc intégrée.

Outils : CodexNiveau : Intermédiairemàj 06/11/2026
OpenAIProductivité et organisation

ATTAC-seq Peaks QC

ngs-atacseq-peaks-qc

Exécuter ou planifier ATAC-seq QC, alignement, enrichissement TSS, taille de fragment, liste noire, pic d'appel, pic de consensus, et flux de travail d'accessibilité différentiels.

Outils : CodexNiveau : Intermédiairemàj 06/11/2026
OpenAIProductivité et organisation

Compétence minimale

minimal-skill

Un exemple minimal de compétence pour les tests plugin-eval.

Outils : CodexNiveau : Intermédiairemàj 06/11/2026
ÉCHANGES

Commentaires.

Un retour d’expérience, une question, une précision sur cette skill ? Les commentaires sont relus avant publication.

Commentaires publiés

Chargement des commentaires…

    Laisser un commentaire

    Charte de modération. Chaque commentaire est relu avant publication. Sont refusés : l’incitation à la haine, les propos injurieux ou discriminatoires, la publicité, le spam et les liens promotionnels, le hors-sujet et les données personnelles d’autrui.